Tout autour de la ville les sites naturels se succèdent, offrant à chaque fois des paysages à couper le souffle. La langue de Barbarie notamment, s'étale sur de nombreux kilomètres au sud de Saint-Louis. Ce long ruban de sable abrite une biodiversité incroyable mais malheureusement en danger puisque la langue continue de perdre du terrain chaque année.
À une quinzaine de kilomètres de Saint-Louis, se trouve l'un des sites naturels les plus importants de la région : la réserve de faune de Gueumbeul. Si vous voulez faire un safari au Sénégal, c'est ici qu'il faut aller pour rencontrer notamment des phacochères, des gazelles, des oryx ou encore des tortues terrestres.
Enfin, si c'est l'observation des oiseaux qui vous intéresse, direction le Parc National des oiseaux de Djoudj, l'une des plus belles et des plus importantes réserves d'oiseaux de toute l'Afrique. Ce parc, immense, s'étend sur plus de 16 000 hectares. C'est un véritable paradis pour les trois millions d'oiseaux qui habitent la région. Au total, 400 espèces peuvent être observées ici dont des pélicans gris, des sarcelles, des grues couronnées, des vautours oricou, des aigrettes, des échassiers, des martins-pêcheurs, des hérons, des oies de Gambie, des cormorans, des cigognes noires, des sarcelles… Le parc des oiseaux de Djoudj peut être visité en solo mais mieux vaut s'accompagner de l'expérience et des connaissances d'un guide naturaliste. Une balade en pirogue permet également d'aller voir le nichoir des cormorans et des pélicans, une excursion gérée par les villageois du coin qui participe donc au soutien de l'économie locale.